La plateforme Imagine NGS, créée en 2008, soutient à la fois la recherche et le diagnostic dans les maladies génétiques rares. Il est équipé des technologies de séquençage les plus avancées (Illumina, PacBio, Oxford Nanopore), et travaille en étroite collaboration avec la plateforme bioinformatique Imagine. La plateforme réalise toutes les étapes de biologie moléculaire nécessaires à la production de données NGS de haute qualité à partir d'échantillons d'ADN et d'ARN, et interagit étroitement avec les chercheurs pour concevoir des expériences, analyser des données et interpréter les résultats.

 Au-delà de la fourniture de services de séquençage, la plateforme est un pôle d'innovation : évaluation et mise en œuvre constantes de nouvelles technologies génomiques à haut débit, développement de nouveaux protocoles et soutien de projets de recherche ambitieux et à grande échelle à l'interface de la découverte et de l'application clinique.

L'ingénieur de recherche aura pour missions :

Missions principales :

Mise en place de nouvelles méthodes, protocoles et appareils de NGS et de génomique, participation à l'activité de la plateforme.

Activités principales :

• Participation au fonctionnement de la plateforme

• Recherche documentaire pour choisir les protocoles adaptés aux applications d’intérêt

• Evaluation de protocoles et optimisation en intéraction avec la plateforme de bioinformatique (séquençage 'short read' et 'long read')

• Mise en place de protocoles standards et définition des contrôles qualités adaptés

• Réalisation du séquençage de nouvelle génération et contrôler son bon déroulement en interaction avec la plateforme de bioinformatique

• Suivi financier des tests et mises au point

• Suivi du fonctionnement des équipements

• Suivi des évolutions technologiques

• Aider au design des projets NGS soumis par les chercheurs

Compétences :

• Expérience dans le domaine du séquençage de nouvelle génération

• Expérience de plateforme souhaitée

• Formation solide en biologie moléculaire

• Manipulation des ADN, ARN, réalisation de PCR, RT-PCR, Q-PCR, génotypage

• Maîtrise de l’anglais scientifique (écrit et parlé)

• Plateforme technologique maîtrisant la partie 'humide' du séquençage de nouvelle génération(NGS)

Diplômes / Formations :

• Formation >=BAC+5

• Thèse de biologie avec expérience en séquençage de nouvelle génération (fabrication des banques et utilisation d'outils bioinformatiques)