Rejoignez un projet de recherche innovant au cœur des enjeux de santé environnementale

La présence de virus dans les milieux aquatiques représente un défi majeur pour la surveillance sanitaire des ressources en eau. Les méthodes de prélèvement classiques présentent aujourd’hui certaines limites, notamment lorsqu’il s’agit de détecter des contaminations faibles ou temporaires.

Dans ce contexte, notre laboratoire développe une approche innovante basée sur l’utilisation du charbon actif en grain (CAG) comme matériau d’échantillonnage passif capable de concentrer les microorganismes présents dans l’eau sur de longues périodes.

Après une première preuve de concept obtenue en 2026, nous recherchons un(e) stagiaire motivé(e) pour poursuivre ces travaux et contribuer au développement de futurs capteurs passifs destinés à la surveillance virologique des eaux de surface et des eaux souterraines.

Vos missions

Au cours de ce stage, vous participerez à un projet mêlant microbiologie environnementale, physicochimie des matériaux et biologie moléculaire.

Vous serez notamment amené(e) à :

🔬 Évaluer les performances de différents charbons actifs

• Étudier la capacité d’adsorption des microorganismes et des virus ;

• Analyser les cinétiques de capture et les phénomènes de saturation ;

• Comparer plusieurs matériaux caractérisés au laboratoire ;

• Évaluer l’impact de différentes matrices aquatiques (eaux usées, eaux de rivière, eaux souterraines).

🧪 Optimiser les méthodes de récupération des microorganismes

• Tester différentes conditions d’élution et d’extraction ;

• Améliorer les rendements de récupération ;

• Limiter les effets inhibiteurs susceptibles d’affecter les analyses moléculaires.

🧬 Caractériser les microorganismes captés

• Détection et quantification de virus par qPCR et/ou dPCR ;

• Exploration de la diversité virale et microbiologique par séquençage métagénomique ;

• Analyse et interprétation des résultats expérimentaux.

Profil recherché

• Étudiant(e) en Master 2 ou école d’ingénieur dans les domaines de la microbiologie, biologie moléculaire, sciences de l’environnement, biotechnologies ou disciplines associées ;

• Intérêt pour la recherche expérimentale et les problématiques de santé environnementale ;

• Goût pour le travail en laboratoire et l’analyse de données ;

• Curiosité scientifique, rigueur et autonomie.

Ce que le stage vous apportera

✅ Une expérience sur un sujet de recherche innovant à fort enjeu sociétal

✅ La maîtrise de techniques avancées de biologie moléculaire (qPCR, dPCR, métagénomique)

✅ Une approche multidisciplinaire à l'interface entre microbiologie environnementale et science des matériaux

✅ Une participation active au développement d'outils de surveillance environnementale de nouvelle génération

Vous souhaitez mettre vos compétences au service d’un projet de recherche innovant ayant un impact concret sur la santé publique et la protection de l’environnement ? Rejoignez-nous !