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stage de fin d'étude - computer vision : Détection des limites chirurgicales sur des lames d'anatomopathologie

Stage(6 mois)
Paris
Salaire : Non spécifié
Début : 03 avril 2022
Télétravail fréquent

Primaa
Primaa

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Questions et réponses sur l'offre

Le poste

Descriptif du poste

L’examen histologique s’inscrit dans la chaîne de dépistage d’un cancer. Il consiste à analyser au niveau microscopique un prélèvement de tissu et permet de confirmer une présence tumorale, qualifier le type de cancer détecté et, ainsi, ajuster la thérapie.

Certains prélèvements se font lors de l’ablation chirurgicale d’une tumeur. Le·a chirurgien·ne prélève le cancer et du tissu sur les contours pour s’assurer que la partie non ablatée de l’organe ne contient plus de tissu tumoral. Lors de l’examen anatomopathologique, il s’agit alors de détecter les limites de l’ablation, ou “limites chirurgicales”, et de s’assurer que les régions tumorales sont suffisamment éloignées de ces limites.

Objectifs du stage

  • développer un algorithme de détection automatique des limites chirurgicales. De la data labélisée sera disponible pour entraîner / valider les algorithmes. Pour cela, on pourra explorer des techniques de machine learning/deep learning et d’image processing standard
  • développer un algorithme de mesure de distance entre la tumeur et les limites chirurgicales. Les limites n’étant parfois pas clairement définies (morceaux manquants, épaisseur variable…), cette tâche nécessitera sans doute l’usage de techniques d’image processing avancées

Infos pratiques

  • rémunération : 1000€/mois + remboursement 50% du navigo
  • Primaa est basée à Paris, dans le 2ème arrondissement

Ce qui est top chez Primaa

  • On travaille pour améliorer la prise en charge des patients… ça compte
  • On travaille au quotidien avec une médecin qui fait partie de l’équipe
  • L’équipe est (vraiment) super sympa
  • On a de super locaux, au centre de paris

Profil recherché

  • M2 / dernière année d’école d’ingénieur
  • stage de 6 mois minimum (début entre Mars et Mai 2022)
  • connaissances en computer vision (image processing, deep learning) : tensorflow et/ou pytorch, scikit-image ….
  • connaissance en python

Déroulement des entretiens

visio ou rencontre avec deux membres de l’équipe data

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